Este artículo analiza cómo las políticas de exclusión racial conducen a peores resultados educativos en la población idígena dentro de entornos racializados y coloniales. Centrándonos en Colombia y Mozambique, mostramos que durante gran parte del siglo xx la población indígena no tuvo acceso a la misma educación que el resto de la población. La mayoría de los niños indígenas solo accedieron a una educación de muy baja calidad en escuelas dirigidas por misiones católicas. Esto, junto con inversiones públicas mucho más bajas en la educación de los pueblos indígenas, puso a los niños indígenas en desventaja para la acumulación de capital humano. Para mostrar dichas diferencias, construimos nuevas estimaciones de tasas de alfabetización y de finalización de la educación primaria para los diferentes grupos étnicos en Colombia y Mozambique durante el siglo xx. Conforme a nuestro argumento, los resultados confirman diferencias sistemáticas en la acumulación de capital humano entre las poblaciones indígenas y no indígenas.